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鼠科Muridae有500余种，是哺乳动物的第二大科，其成员非常多样化，可以分成几个亚科，其中多数成员属于鼠亚科Murinae 。鼠科中鼠属的黑家鼠Rattus rattus、褐家鼠Rattus norvegicus和小鼠属的小家鼠Mus musculus（右图）随着人类到达了世界各地，是最成功最常见的哺乳动物，一般视为害兽，也被培养出白化品种供医药试验用 。除了人为扩散的种类外，鼠科的自然分布则只限于旧大陆，其中有不少种类分布局限，也有一些种类濒于灭绝或者已经灭绝 。鼠科有两个分布中心，一个分布中心是亚洲南部到大洋洲一带，其中以南洋群岛属种最为丰富，另一个分布中心是非洲，其种类少于上一地区 。这两个地区分别拥有各自的属种，只有小鼠属Mus等极少数为两个地区所共有 。除了随着人类传播的几种家鼠以外，鼠科只有姬鼠属Apodemus和巢鼠属Micromys两个属可见于欧洲和亚洲北部，拟家鼠Rattus rattoides等少数种类分布于亚洲其它地区以外，鼠科的其它种类均局限于这两个地区，其中巢鼠属仅巢鼠Micromys minutus（左图）一种，分布于欧亚大陆广大地区，体小轻盈，是体型最小的啮齿类之一，尾部具缠绕性，可以在禾草上攀爬，又称旧大陆禾鼠，与新大陆仓鼠类真正的禾鼠相对应 。鼠科成员适应不同的生存环境，形态和习性都比较多样化 。典型的鼠科成员形态和习性与家鼠类似，但也有些则有较大区别，如澳洲的澳洲水鼠Hydromys chrysogaster体型较大，体重可达一公斤，半水栖性，以鱼和其它水生动物为食；澳洲的窜鼠Notomys为双足跳跃行动，主要生活于荒漠地带，类似美洲的更格卢鼠；非洲的刺鼠Acomys、琉球群岛的琉球刺鼠Tokudaia和从睡鼠亚科移入的刺睡鼠（刺毛鼠）Platacanthomys等身上的毛成为了有保护作用的棘刺；还有不少种类适应树栖生活 。鼠科中光是鼠属一个属内就有水栖、树栖以及有刺成员等多种不同的成员 。鼠属Rattus是啮齿类最大的一个属，也是最混乱的一个属，有人认为超过180种，是哺乳动物的最大一属，也有人将一些成员合并或移出，只剩下分布基本限于东南亚和大洋洲的大约80种，种类少于食虫目麝鼩属，但即使这样，仍然是啮齿目的最大一属 。
开普刺鼠Acomys subspinosus
北澳窜鼠Notomys alexis
澳洲水鼠Hydromys chrysogaster
仓鼠科Circetidae
仓鼠科Circetidae是哺乳动物的最大一科，现存种类超过600种，化石种类也不少，可以分成几个不同的亚科和族，而这些亚科和族的划分争议比较大 。仓鼠科以新大陆种类最多，其中南美洲所有的鼠型亚目成员均数此类，其次是欧亚大陆北部，是欧亚大陆北部的主要鼠类，在非洲大陆和马达加斯加也有分布，并且是马达加斯加仅有的啮齿类，而在鼠科的分布中心亚洲东南部和大洋洲却没有分布 。
西方鼠亚科（黄昏鼠亚科）Hesperomyinae主要分布于中南美洲，少数分布于北美洲，是南美洲仅有的鼠型亚目成员，由于缺少其它啮齿类的竞争，发展成了种类繁多，生活习性非常多样的一个类群，约有350种，超过了仓鼠科的半数 。西方鼠亚科的多数成员外形和习性类似旧大陆的鼠科的典型成员，占据着鼠科在就大陆的位置，但是也包括食昆虫和小型动物的成员，食鱼和食水生无脊椎动物的半水栖成员，穴居的成员和树栖的成员，占据着各种不同的生存环境 。
盐沼禾鼠Reithrodontomys raviventris
仓鼠亚科Cricetinae与西方鼠亚科可能有较近的亲缘关系，有人将西方鼠亚科并入仓鼠亚科 。仓鼠主要分布于亚洲，少数分布于欧洲，其中不少种比较适应干旱地区的生活，另有一种白尾匙鼠Mystromys albicaudatus分布于非洲，也有人将白尾匙鼠归入马岛鼠亚科 。典型的仓鼠亚科成员体型肥胖，尾短，比较可爱，其中原分布于中近东地区的金仓鼠Mesocicetus auratus被广泛作为宠物来饲养，被称为“金丝熊” 。
金仓鼠Mesocicetus auratus
鼢鼠亚科Myospalacinae是适应地下生活的啮齿类，尾短，眼睛很小，视力差，外耳退化，仅是小的皮褶 。鼢鼠主要分布于我国，也见于蒙古和西伯利亚，栖息于森林边远、草原和农田，白天居住在地洞中，晚上偶尔会到地面活动，以植物的根、茎、种子为食，在洞穴中储存大量食物 。鼢鼠挖洞速度极快，洞穴系统复杂，分支多，平时地面没有明显出口，但附近有不规则的土堆 。
马岛鼠亚科Nesomyinae因分布于马达加斯加岛而得名，是岛上仅有的啮齿类，共有十多种 。马岛鼠种类虽然不多，但是非常多样，有树栖也有陆栖，还有跳跃行走的成员，其食性也从植物到昆虫均有 。有人认为岛上这些不同的鼠类不是单一起源，可以将马岛鼠亚科取消而将其成员分别置于其它类群 。
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